Alignment1 read alignment STAR STAR 정렬기는 RNA-Seq 읽기를 참조 게놈에 정렬하는 데 널리 사용되는 도구입니다. 시드 검색 및 클러스터링, 스티칭, 스코어링이라는 2단계 접근 방식 덕분에 프로세스가 매우 효율적이고 정확합니다. 1. 시드 검색 이 단계에서 STAR는 RNA-Seq 읽기와 참조 게놈 간의 가장 긴 연속 일치를 식별합니다. 이러한 일치를 최대 매핑 가능 접두사(MMP)라고 합니다. 읽기는 "시드"라고 불리는 세그먼트로 나뉘며 STAR는 각 시드에 대해 가장 긴 정확한 일치를 찾습니다. 먼저 하나의 시드를 매핑한 다음 읽기의 다음 매핑되지 않은 부분으로 이동하여 전체 읽기가 정렬되거나 더 이상 일치할 수 없을 때까지 프로세스를 반복합니다. 읽기를 여러 개의 시드로 분해하는 이 방법은 특히 큰 게놈의 정렬 속도를 높.. 2024. 9. 5. 이전 1 다음
