Gene Ontology (GO) Enrichment analysis 개념 정리

• GO는 세 가지로 구분

1.Molecular Function (MF) : 해당 유전자가 분자 수준에서 수행하는 어떤 활동/기능.
  Ex) 효소 촉매 작용, 물질 운반

2.Biological Process (BP): 해당 유전자가 관여하는 어떤 생물학적 과정.
  Ex) DNA 복구, 신호 전달 경로

3.Cellular Component (CC): 해당 유전자가 위치하는 세포 내 구조적 위치.
  Ex) 미토콘드리아, 세포막

• GO Enrichment analysis : 특정 유전자 리스트에서 관련된 MF, BP 또는 CC가 통계적으로 유의미하게 포함되는지 평가하는 분석 방법.

 
• The structure of GO can be described in terms of a graph, where each GO term is a node, and the relationships between the terms are edges between the nodes.

EX) GSE62452 (pancreatic tumors)의 Gene Ontology Enrichment결과 중, GO:0009986-cell surface

 
< 참고 문서 >
https://geneontology.org/docs/ontology-documentation/ 
https://geneontology.org/docs/ontology-relations/

https://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0009986
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0009986