Pathway Enrichment analysis 개념 정리

Pathway : 단백질, 유전자, 세포 등 생체 요소간의 상호작용과 역학관계를 세밀하게 설명할 수 있는 생물학적 심층지식

 

Pathway분석을 위해서는 pathway 데이터베이스가 있어야 한다. 이 데이터베이스들은 실험적인 결과 및 논문을 기반으로 하여 만들어 진다. 특정한 분자들이 서로 연관관계가 있는 다른 분자와의 연결을 할 때에 데이터베이스를 기반으로 하기 때문에 이 데이터베이스의 퀄리티에 따라 pathway의 신빙성도 달라진다.

공공데이터로는 가장 많이 사용되는 KEGG pathway와 wikipathways가 있다.
또한, Reactome 데이터베이스는 전문가들이 선별한 pathway 데이터를 제공하는 유명한 공개 데이터베이스 중 하나다.
 
< 참고 문서 >
https://www.incodom.kr/Pathway_%EB%B6%84%EC%84%9D_%EB%B0%8F_%EB%B6%84%EC%84%9D_%EC%86%94%EB%A3%A8%EC%85%98
 
https://www.snu.ac.kr/research/highlights?md=v&bbsidx=136819