AI, 논문, 데이터 분석56 SmartSeq2(Smart Sequencing Technology 2) SmartSeq2(Smart Sequencing Technology 2)는 RNA 시퀀싱 기술 중 하나로, 단일 세포 RNA 시퀀싱(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)에서 주로 사용됩니다. 이 기술은 세포 내에서 발현되는 전체 전사체(transcriptome)를 높은 민감도로 분석할 수 있도록 개발되었습니다. mRNA 추출 및 역전사 준비:우선, 단일 세포에서 추출된 mRNA가 분석의 시작점입니다. mRNA에는 폴리(A) 꼬리가 존재하며, 이는 SmartSeq2에서 중요하게 사용됩니다.SmartSeq2는 RNA의 5' 말단에서 특수한 스위칭 메커니즘을 사용하여 전사체의 첫 번째 가닥 합성에 중요한 역할을 합니다.mRNA 조각화 (Fragmentation):mRNA는 짧은.. 2024. 9. 5. Transcriptome analysis based on machine learning reveals a role for autoinflammatory genes of chronic nonbacterial osteomyelitis (CNO) Materials and methodsDataset download and preprocessingOnly two eligible RNA-seq datasets (GSE133378 and GSE187429) in GEO. https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE133nnn/GSE133378/ Index of /geo/series/GSE133nnn/GSE133378 ftp.ncbi.nlm.nih.govNCBI GEO (Gene Expression Omnibus) 데이터베이스는 유전자 발현 및 기타 기능 유전체 데이터의 공개 저장소입니다. 해당 링크에서 4개의 디렉토리는 각기 다른 형식과 목적으로 데이터를 제공합니다. 각 디렉토리의 차이점은 다음과 같습니다: 1. **m.. 2024. 7. 2. 이전 1 ··· 7 8 9 10 다음
