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[Hierarchical MIL] Code ; Train.py 논문Incorporating Hierarchical Information into Multiple Instance Learning for Patient Phenotype Prediction with scRNA-seq Datahttps://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.02.10.637389v1.full.pdf  논문 정리2025.03.22 - [AI 및 Data Analysis/Paper] - [Hierarchical MIL] Incorporating Hierarchical Information into Multiple Instance Learning for Patient Phenotype Prediction with scRNA-seq Data [Hierarchical.. 2025. 3. 27.
[Optuna] Key Concepts and Descriptions 🧠 Optuna란? Optuna는 자동 하이퍼파라미터 튜닝을 위한 오픈소스 라이브러리입니다. 예를 들어…모델을 학습할 때 이런 하이퍼파라미터들이 있어요:학습률 (lr)은닉층 크기 (n_hid)드롭아웃 비율 (dropout)에폭 수 (n_epochs)weight decay 등등이걸 사람이 손으로 하나씩 실험하는 건 너무 오래 걸리고 비효율적이죠. 🔧 그래서 Optuna는 이런 일을 자동화해 줍니다:시도할 파라미터 조합을 스마트하게 선택성능(AUC 등) 을 기준으로 가장 좋은 조합을 찾음내부적으로는 Bayesian optimization 기반 알고리즘 사용즉, Optuna는:"최고의 모델을 만들기 위해 하이퍼파라미터를 똑똑하게 조합해서 실험하는 자동화된 연구원"🔁 과정 자세히 설명Optuna가 하이퍼파.. 2025. 3. 27.
[Docker] 서버 배포를 위한 Docker 코드 작성 및 실행 배포를 위해 Docker를 사용해보자.간략히 보면, 내 코드를 Images로 만들어서 서버에 올리는 과정이다.STEP 1 :내 코드를 어떻게 Images로 만들지에 대한 설명서인 ⇨ Dockerfile 작성 STEP 2 :Dockerfile 기반으로 ⇨ Images를 생성.해당 이미지를 바탕으로 ⇨ Container 생성 및 실행 ! (이미지가 설계도라면, 컨테이너는 그 설계도로 만든 실제 제품!) * 사실상 끝. 근데 이것을 Hub라는 '인터넷 상의 클라우드 보관소'에 올려서 누구나 사용할 수 있도록 공유하는 과정을 진행할 수 있다. (마치 깃허브에 코드 올려놓는 것 처럼.) STEP 3 : Images를 Docker Hub에 올리기 * 다른 사람이 이미지를 pull 받아서, Container 실행하면.. 2025. 3. 26.
[Server] Send(Copy) local data to Server 로컬 나의 컴퓨터에 저장되어 있는 파일을, 서버로 업로드(복사)하자.문제 상황 >vsCode에서 복붙으로 파일을 서버에 업로드하니 자꾸 실패한다.해결 방법 > 로컬 PC에서 scp로 전송Windows 명령 프롬프트(CMD)나 PowerShell에서 아래 실행scp -P 포트번호 "C:\Users\LG\Downloads\복사할파일경로test.txt" 서버ID@서버IP주소:/data/project/hier-mil/data/cardio/복사할서버경로scp -P 7777 "C:\Users\LG\Downloads\DCM_HCM_Expression_Matrix_raw_counts_V1.mtx" kim89@서버IP주소:/data/project/hier-mil/data/cardio/ 2025. 3. 24.
[Hierarchical MIL] scRNA Analysis 논문Incorporating Hierarchical Information into Multiple Instance Learning for Patient Phenotype Prediction with scRNA-seq Datahttps://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.02.10.637389v1.full.pdf 논문 정리2025.03.22 - [AI 및 Data Analysis/Paper] - [Hierarchical MIL] Incorporating Hierarchical Information into Multiple Instance Learning for Patient Phenotype Prediction with scRNA-seq Data [Hierarchical .. 2025. 3. 24.
[Alzheimer] 녹음 파일 불러와서 이미지로 변환하기 녹음 파일 경로IB-APPS 폴더 안에 여러개의 폴더가 있다. 각 폴더 안에, 11가지 종류의 음성 파일이 있다. 각 음성파일은 4가지 버젼으로 이루어져 있다.데이터 선정AI 모델 학습에  _R.flac 파일 사용하자. (R.json이 존재하니) 음성 데이터 가져와서, 이미지 형태로 변환하기import osimport jsonimport librosaimport librosa.displayimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npdef Mel_Spectrogram(wav_file, save_file, sr=48000): y, _ = librosa.load(wav_file, sr=sr) S = librosa.feature.melspectrogram(.. 2025. 3. 23.

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